Ojciec Aikawy Wataru zostaje przeniesiony za granicę. Widząc to jako idealną okazję, Wataru decyduje się zostać w Japonii i mieszkać samodzielnie. Chociaż jest nowym uczniem przeniesionym, jego nauczyciel przekonuje go, aby został Przedstawicielem Biblioteki. Inny Przedstawiciel Biblioteki mówi mu, że brakuje im jednego członka i prosi Wataru, aby go znalazł. Nie wiedząc, jak ona wygląda, błąka się po szkole, próbując ją znaleźć, tylko po to, by zauważyć, jak dwie dziewczyny plotkują na jej temat negatywnie. Okazuje się, że osoba, której szuka, nie jest lubiana z powodu swojej złej osobowości. Jej imię to Kobayakawa Rinko, ale jaka jest przyczyna jej złego zachowania?

Pewnego dnia w Rosji w małym miasteczku zostaje wypuszczony śmiercionośny wirus. Powód nie jest znany. Po pewnym czasie zaistniały obawy, iż ta sama sytuacja powtórzy się w Tokio. THIRD-i to jednostka, która walczy z terroryzmem. Takagi Fujimaru jest synem jednego z pracowników tej jednostki, a także genialnym hakerem. Fujimaru zaczyna pomagać THIRD-i przy walce z terroryzmem.