Ojciec Aikawy Wataru zostaje przeniesiony za granicę. Widząc to jako idealną okazję, Wataru decyduje się zostać w Japonii i mieszkać samodzielnie. Chociaż jest nowym uczniem przeniesionym, jego nauczyciel przekonuje go, aby został Przedstawicielem Biblioteki. Inny Przedstawiciel Biblioteki mówi mu, że brakuje im jednego członka i prosi Wataru, aby go znalazł. Nie wiedząc, jak ona wygląda, błąka się po szkole, próbując ją znaleźć, tylko po to, by zauważyć, jak dwie dziewczyny plotkują na jej temat negatywnie. Okazuje się, że osoba, której szuka, nie jest lubiana z powodu swojej złej osobowości. Jej imię to Kobayakawa Rinko, ale jaka jest przyczyna jej złego zachowania?
Akcja mangi toczy się w bliskiej przyszłości, gdzie dużą popularnością cieszą się przenośne komputery wmontowane w okulary i umożliwiające połączenie dwóch światów rzeczywistego oraz wirtualnego. Bohaterowie Dennou Coil to grupa jedenastolatków, próbująca rozwikłać tajemnice, które kryje strefa Dennou, widoczna jedynie dzięki specjalnym soczewkom naszpikowanym elektroniką okularów. Yasako i Isako wraz z przyjaciółmi i znajomymi spotkają na swojej drodze nie lada przeszkody, w rozwiązaniu których pomagać będą im cyfrowe pupilki oraz młodsza i niezwykle rezolutna siostra Yasako Kyiouko. Opis pochodzi z shinden-underground.